Le comité de pilotage (Copil) pour l’élaboration du document d'objecitfs (Docob) a été installé par le préfet de Lot-et-Garonne le 29 juin 2010. À cette occasion, les représentants des collectivités territoriales ont désigné M Jacques BILIRIT, vice-président du conseil départemental du Lot-et-Garonne et maire de Fourques-sur-Garonne, pour assurer la présidence du comité de pilotage.
Les études et l’animation pour l’élaboration du DOCOB sont assurées par le Syndicat mixte d'études et d'aménagement de la Garonne.
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26 mai 2011 à Marmande : 1er Copil de lancement de l’élaboration du DOCOB ; les études sont confiées au bureau d’études Biotope
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7 février 2012 à La Réole : Second Copil de présentation des inventaires naturalistes et des activités socio-économiques
- 27 juin 2012 à Agen : 3ème Copil de validation de l’analyse écologique et des objectifs de conservation des milieux et des espèces
- 17 et 18 décembre 2012 à Cadillac et Agen : groupes de travail sur la définition et hiérarchisation des objectifs de développement durable
- 12 et 14 février 2012 à Cadillac et Boé : groupes de travail sur les propositions d’actions
- 25 juin 2013 à Fourques-sur-Garonne : 4ème Copil de présentation du programme d’actions élaboré par les groupes de travail et proposition de périmètre du site
- 19 novembre 2013 à Fourques-sur-Garonne : 5ème et dernier Copil, validation des fiches actions, de la charte Natura 2000, du document de synthèse et du périmètre du site.